สารก่อภูมิแพ้หลักในฤดูใบไม้ร่วงคือละอองเรณูไรฝุ่นเชื้อรา ฯลฯ
ในหลายภูมิภาคประเภทและปริมาณของละอองเกสรสารก่อภูมิแพ้ค่อยๆเพิ่มขึ้นหลังจากเริ่มต้นฤดูใบไม้ร่วงเข้าสู่จุดสูงสุดของการแพ้ละอองเรณู นอกจากนี้สารก่อภูมิแพ้ละอองเรณูในฤดูใบไม้ร่วงส่วนใหญ่เป็นละอองเกสรวัชพืชซึ่งมีอาการแพ้ที่แข็งแรงขึ้น
แหล่งที่มาหลักของละอองเกสรในฤดูใบไม้ร่วง ได้แก่ พืชอาร์เทมซิเซีย (เช่นอาร์เทมซิเซียแอนนา), พืช Chenopodiaceae (เช่นผักสีเทา) และพืช ragweed ในหมู่พวกเขาละอองเกสรดอกไม้อาร์เทมซิเซียมีการใช้งานโดยเฉพาะในฤดูใบไม้ร่วงและบางคนสามารถพบกับอาการแพ้อย่างรุนแรงด้วยละอองเกสรอาร์เทมซิเซียเพียงเล็กน้อยเท่านั้น
นอกจากนี้ความชื้นและอุณหภูมิในช่วงปลายฤดูร้อนและต้นฤดูใบไม้ร่วงสร้างเงื่อนไขที่ดีสำหรับไรฝุ่นและยังเหมาะสำหรับการเจริญเติบโตของเชื้อรา น้ำค้างตอนเช้าฤดูใบไม้ร่วงหรือปริมาณน้ำฝนตกค้างใบที่ร่วงหล่นและพืชผุพังสามารถส่งเสริมการเจริญเติบโตของเชื้อรา เมื่อผู้คนเข้ามาสัมผัสหรือสูดดมสปอร์แม่พิมพ์พวกเขาก็มีแนวโน้มที่จะแพ้
ในเวลาเดียวกันหลังจากอุณหภูมิลดลงในฤดูใบไม้ร่วงสภาพอากาศจะแห้งและปริมาณอนุภาคขนาดเล็กเช่นฝุ่นในอากาศเพิ่มขึ้นกลายเป็นสารก่อภูมิแพ้ที่สำคัญ ความแตกต่างของอุณหภูมิขนาดใหญ่ระหว่างกลางวันและกลางคืนในฤดูใบไม้ร่วงและการกระตุ้นอากาศเย็นบนเยื่อบุจมูกสามารถนำไปสู่ vasoconstriction และการทำงานของสิ่งกีดขวางลดลงทำให้เกิดความไว
